Der wichtigste Punkt für die erfolgreiche Arbeit des Darmzentrums ist sicherlich die interdisziplinäre Zusammenarbeit und die Verknüpfung des ambulanten mit dem stationären Sektor durch die verschiedenen Kooperationen. Die Organisationsstruktur des Darmzentrums Prien am Chiemsee ist im folgenden Organigramm dargestellt:
